В природном заповеднике есть множество редкостных и необычных животных и растений. Главным и самым известным растением на островах является кактус опунция. У него практически нет конкурентов, так как дожди здесь выпадают крайне редко, 8 месяцев в году их попросту нет. Кактус вырастает до 10 метров в длину, а ствол покрыт древесной корой.
Млекопитающих здесь проживает всего 9 видов, их нельзя встретить больше нигде, только на Галапагосских островах. Морские игуаны, ящерицы и черепахи являются главными украшениями архипелага. Огромные черепахи с метровым панцирем относятся к долгожителям мировой фауны. В среднем они проживают около 200 лет.
Птиц на архипелаге на много больше, их там 60 видов. Половина обитает только здесь. Галапагосские голуби, канюки, бакланы и олуши водятся исключительно на островах. Самое удивительное, что здесь проживают и пингвины.
На побережье и в море кипит жизнь. Наверное, поэтому эти места облюбовали дайверы. Кроме китов, дельфинов, тропических рыбок, морских котиков и львов можно встретить множество иных обитателей, которые покажут себя в полной красе в своей родной стихии.